Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ3

NCKIPSD, NCK-interacting protein with SH3 domain, humanhuman

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKIPSDQ9NZQ3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCKIPSDQ9NZQ3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms