Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
C9orf78Q9NZ63 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C9orf78Q9NZ63 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C9orf78Q9NZ63 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
C9orf78Q9NZ63 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
C9orf78Q9NZ63 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
C9orf78Q9NZ63 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
C9orf78Q9NZ63 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
C9orf78Q9NZ63 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
C9orf78Q9NZ63 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
C9orf78Q9NZ63 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
C9orf78Q9NZ63 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
C9orf78Q9NZ63 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
C9orf78Q9NZ63 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
C9orf78Q9NZ63 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C9orf78Q9NZ63 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C9orf78Q9NZ63 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C9orf78Q9NZ63 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C9orf78Q9NZ63 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C9orf78Q9NZ63 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C9orf78Q9NZ63 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C9orf78Q9NZ63 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C9orf78Q9NZ63 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C9orf78Q9NZ63 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
C9orf78Q9NZ63 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
C9orf78Q9NZ63 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
C9orf78Q9NZ63 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
C9orf78Q9NZ63 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
C9orf78Q9NZ63 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
C9orf78Q9NZ63 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
C9orf78Q9NZ63 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
C9orf78Q9NZ63 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
C9orf78Q9NZ63 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
C9orf78Q9NZ63 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
C9orf78Q9NZ63 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
C9orf78Q9NZ63 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
C9orf78Q9NZ63 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C9orf78Q9NZ63 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C9orf78Q9NZ63 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C9orf78Q9NZ63 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
C9orf78Q9NZ63 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C9orf78Q9NZ63 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C9orf78Q9NZ63 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
C9orf78Q9NZ63 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C9orf78Q9NZ63 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
C9orf78Q9NZ63 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
C9orf78Q9NZ63 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
C9orf78Q9NZ63 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
C9orf78Q9NZ63 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
C9orf78Q9NZ63 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms