Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM53CQ9NYF3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms