Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE4

SMPD4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD4Q9NXE4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMPD4Q9NXE4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMPD4Q9NXE4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMPD4Q9NXE4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMPD4Q9NXE4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMPD4Q9NXE4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMPD4Q9NXE4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMPD4Q9NXE4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMPD4Q9NXE4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMPD4Q9NXE4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMPD4Q9NXE4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMPD4Q9NXE4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMPD4Q9NXE4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMPD4Q9NXE4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMPD4Q9NXE4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMPD4Q9NXE4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SMPD4Q9NXE4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMPD4Q9NXE4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMPD4Q9NXE4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMPD4Q9NXE4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMPD4Q9NXE4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SMPD4Q9NXE4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMPD4Q9NXE4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMPD4Q9NXE4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMPD4Q9NXE4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMPD4Q9NXE4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMPD4Q9NXE4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SMPD4Q9NXE4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMPD4Q9NXE4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SMPD4Q9NXE4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMPD4Q9NXE4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SMPD4Q9NXE4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SMPD4Q9NXE4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SMPD4Q9NXE4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMPD4Q9NXE4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMPD4Q9NXE4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMPD4Q9NXE4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMPD4Q9NXE4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMPD4Q9NXE4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMPD4Q9NXE4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMPD4Q9NXE4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMPD4Q9NXE4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMPD4Q9NXE4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMPD4Q9NXE4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMPD4Q9NXE4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SMPD4Q9NXE4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SMPD4Q9NXE4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMPD4Q9NXE4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMPD4Q9NXE4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMPD4Q9NXE4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMPD4Q9NXE4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMPD4Q9NXE4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms