Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX47

MARCH5, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH5, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH5Q9NX47 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCH5Q9NX47 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCH5Q9NX47 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCH5Q9NX47 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCH5Q9NX47 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCH5Q9NX47 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCH5Q9NX47 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCH5Q9NX47 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCH5Q9NX47 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCH5Q9NX47 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCH5Q9NX47 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCH5Q9NX47 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCH5Q9NX47 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCH5Q9NX47 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCH5Q9NX47 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCH5Q9NX47 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCH5Q9NX47 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCH5Q9NX47 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCH5Q9NX47 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCH5Q9NX47 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCH5Q9NX47 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCH5Q9NX47 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCH5Q9NX47 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCH5Q9NX47 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCH5Q9NX47 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCH5Q9NX47 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCH5Q9NX47 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MARCH5Q9NX47 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms