Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
C1orf109Q9NX04 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms