Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM248Q9NWD8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM248Q9NWD8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM248Q9NWD8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM248Q9NWD8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM248Q9NWD8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM248Q9NWD8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM248Q9NWD8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM248Q9NWD8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM248Q9NWD8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM248Q9NWD8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM248Q9NWD8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM248Q9NWD8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM248Q9NWD8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM248Q9NWD8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms