Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVN3

RIC8B, Synembryn-B, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIC8BQ9NVN3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIC8BQ9NVN3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms