Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GINM1Q9NU53 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GINM1Q9NU53 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GINM1Q9NU53 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GINM1Q9NU53 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GINM1Q9NU53 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GINM1Q9NU53 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GINM1Q9NU53 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GINM1Q9NU53 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GINM1Q9NU53 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GINM1Q9NU53 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GINM1Q9NU53 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GINM1Q9NU53 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GINM1Q9NU53 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GINM1Q9NU53 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GINM1Q9NU53 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GINM1Q9NU53 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GINM1Q9NU53 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GINM1Q9NU53 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GINM1Q9NU53 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GINM1Q9NU53 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GINM1Q9NU53 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GINM1Q9NU53 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms