Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
RRP7BPQ9NSQ0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
RRP7BPQ9NSQ0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
RRP7BPQ9NSQ0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
RRP7BPQ9NSQ0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
RRP7BPQ9NSQ0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
RRP7BPQ9NSQ0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
RRP7BPQ9NSQ0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
RRP7BPQ9NSQ0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
RRP7BPQ9NSQ0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
RRP7BPQ9NSQ0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
RRP7BPQ9NSQ0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
RRP7BPQ9NSQ0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
RRP7BPQ9NSQ0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
RRP7BPQ9NSQ0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
RRP7BPQ9NSQ0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
RRP7BPQ9NSQ0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
RRP7BPQ9NSQ0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
RRP7BPQ9NSQ0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
RRP7BPQ9NSQ0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
RRP7BPQ9NSQ0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
RRP7BPQ9NSQ0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RRP7BPQ9NSQ0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RRP7BPQ9NSQ0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RRP7BPQ9NSQ0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
RRP7BPQ9NSQ0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
RRP7BPQ9NSQ0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RRP7BPQ9NSQ0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
RRP7BPQ9NSQ0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RRP7BPQ9NSQ0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RRP7BPQ9NSQ0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RRP7BPQ9NSQ0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
RRP7BPQ9NSQ0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RRP7BPQ9NSQ0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
RRP7BPQ9NSQ0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
RRP7BPQ9NSQ0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
RRP7BPQ9NSQ0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
RRP7BPQ9NSQ0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
RRP7BPQ9NSQ0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
RRP7BPQ9NSQ0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
RRP7BPQ9NSQ0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
RRP7BPQ9NSQ0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
RRP7BPQ9NSQ0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
RRP7BPQ9NSQ0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
RRP7BPQ9NSQ0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
RRP7BPQ9NSQ0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
RRP7BPQ9NSQ0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
RRP7BPQ9NSQ0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
RRP7BPQ9NSQ0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RRP7BPQ9NSQ0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RRP7BPQ9NSQ0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RRP7BPQ9NSQ0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RRP7BPQ9NSQ0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RRP7BPQ9NSQ0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
RRP7BPQ9NSQ0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RRP7BPQ9NSQ0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RRP7BPQ9NSQ0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC34.17■■■■□ 3.06
RRP7BPQ9NSQ0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
RRP7BPQ9NSQ0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
RRP7BPQ9NSQ0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC34.17■■■■□ 3.06
RRP7BPQ9NSQ0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
RRP7BPQ9NSQ0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
RRP7BPQ9NSQ0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RRP7BPQ9NSQ0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RRP7BPQ9NSQ0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
RRP7BPQ9NSQ0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RRP7BPQ9NSQ0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RRP7BPQ9NSQ0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RRP7BPQ9NSQ0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RRP7BPQ9NSQ0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RRP7BPQ9NSQ0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RRP7BPQ9NSQ0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
RRP7BPQ9NSQ0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
RRP7BPQ9NSQ0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
RRP7BPQ9NSQ0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
RRP7BPQ9NSQ0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RRP7BPQ9NSQ0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RRP7BPQ9NSQ0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
RRP7BPQ9NSQ0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RRP7BPQ9NSQ0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
RRP7BPQ9NSQ0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
RRP7BPQ9NSQ0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RRP7BPQ9NSQ0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RRP7BPQ9NSQ0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RRP7BPQ9NSQ0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RRP7BPQ9NSQ0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
RRP7BPQ9NSQ0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
RRP7BPQ9NSQ0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RRP7BPQ9NSQ0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RRP7BPQ9NSQ0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RRP7BPQ9NSQ0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RRP7BPQ9NSQ0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RRP7BPQ9NSQ0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RRP7BPQ9NSQ0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RRP7BPQ9NSQ0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
RRP7BPQ9NSQ0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms