Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SALL1Q9NSC2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SALL1Q9NSC2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SALL1Q9NSC2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SALL1Q9NSC2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SALL1Q9NSC2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SALL1Q9NSC2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SALL1Q9NSC2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SALL1Q9NSC2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SALL1Q9NSC2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SALL1Q9NSC2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SALL1Q9NSC2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SALL1Q9NSC2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SALL1Q9NSC2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SALL1Q9NSC2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SALL1Q9NSC2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SALL1Q9NSC2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SALL1Q9NSC2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SALL1Q9NSC2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SALL1Q9NSC2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
SALL1Q9NSC2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SALL1Q9NSC2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SALL1Q9NSC2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SALL1Q9NSC2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SALL1Q9NSC2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SALL1Q9NSC2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SALL1Q9NSC2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SALL1Q9NSC2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SALL1Q9NSC2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SALL1Q9NSC2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SALL1Q9NSC2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SALL1Q9NSC2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SALL1Q9NSC2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SALL1Q9NSC2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SALL1Q9NSC2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SALL1Q9NSC2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SALL1Q9NSC2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SALL1Q9NSC2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SALL1Q9NSC2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SALL1Q9NSC2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms