Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS64

RPRM, Protein reprimo, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMQ9NS64 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPRMQ9NS64 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms