Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SERINC1Q9NRX5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms