Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

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Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGB3Q9NQW8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGB3Q9NQW8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGB3Q9NQW8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGB3Q9NQW8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGB3Q9NQW8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGB3Q9NQW8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGB3Q9NQW8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGB3Q9NQW8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNGB3Q9NQW8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNGB3Q9NQW8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNGB3Q9NQW8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNGB3Q9NQW8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNGB3Q9NQW8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNGB3Q9NQW8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CNGB3Q9NQW8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNGB3Q9NQW8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNGB3Q9NQW8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNGB3Q9NQW8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNGB3Q9NQW8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNGB3Q9NQW8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CNGB3Q9NQW8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNGB3Q9NQW8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CNGB3Q9NQW8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNGB3Q9NQW8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNGB3Q9NQW8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGB3Q9NQW8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGB3Q9NQW8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGB3Q9NQW8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGB3Q9NQW8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGB3Q9NQW8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGB3Q9NQW8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGB3Q9NQW8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGB3Q9NQW8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGB3Q9NQW8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGB3Q9NQW8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGB3Q9NQW8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGB3Q9NQW8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGB3Q9NQW8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CNGB3Q9NQW8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
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