Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ79

CRTAC1, Cartilage acidic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTAC1Q9NQ79 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CRTAC1Q9NQ79 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRTAC1Q9NQ79 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRTAC1Q9NQ79 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CRTAC1Q9NQ79 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRTAC1Q9NQ79 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRTAC1Q9NQ79 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRTAC1Q9NQ79 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRTAC1Q9NQ79 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRTAC1Q9NQ79 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRTAC1Q9NQ79 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRTAC1Q9NQ79 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CRTAC1Q9NQ79 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRTAC1Q9NQ79 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRTAC1Q9NQ79 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRTAC1Q9NQ79 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRTAC1Q9NQ79 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRTAC1Q9NQ79 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRTAC1Q9NQ79 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRTAC1Q9NQ79 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRTAC1Q9NQ79 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CRTAC1Q9NQ79 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRTAC1Q9NQ79 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRTAC1Q9NQ79 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CRTAC1Q9NQ79 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRTAC1Q9NQ79 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRTAC1Q9NQ79 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRTAC1Q9NQ79 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRTAC1Q9NQ79 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRTAC1Q9NQ79 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRTAC1Q9NQ79 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRTAC1Q9NQ79 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRTAC1Q9NQ79 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRTAC1Q9NQ79 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRTAC1Q9NQ79 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRTAC1Q9NQ79 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRTAC1Q9NQ79 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRTAC1Q9NQ79 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRTAC1Q9NQ79 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRTAC1Q9NQ79 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRTAC1Q9NQ79 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRTAC1Q9NQ79 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRTAC1Q9NQ79 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRTAC1Q9NQ79 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRTAC1Q9NQ79 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRTAC1Q9NQ79 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CRTAC1Q9NQ79 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRTAC1Q9NQ79 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRTAC1Q9NQ79 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRTAC1Q9NQ79 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRTAC1Q9NQ79 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRTAC1Q9NQ79 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRTAC1Q9NQ79 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRTAC1Q9NQ79 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRTAC1Q9NQ79 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRTAC1Q9NQ79 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRTAC1Q9NQ79 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRTAC1Q9NQ79 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRTAC1Q9NQ79 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRTAC1Q9NQ79 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRTAC1Q9NQ79 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRTAC1Q9NQ79 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRTAC1Q9NQ79 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRTAC1Q9NQ79 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CRTAC1Q9NQ79 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CRTAC1Q9NQ79 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRTAC1Q9NQ79 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRTAC1Q9NQ79 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CRTAC1Q9NQ79 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRTAC1Q9NQ79 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRTAC1Q9NQ79 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CRTAC1Q9NQ79 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRTAC1Q9NQ79 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRTAC1Q9NQ79 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRTAC1Q9NQ79 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRTAC1Q9NQ79 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRTAC1Q9NQ79 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRTAC1Q9NQ79 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRTAC1Q9NQ79 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CRTAC1Q9NQ79 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRTAC1Q9NQ79 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRTAC1Q9NQ79 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRTAC1Q9NQ79 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRTAC1Q9NQ79 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRTAC1Q9NQ79 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRTAC1Q9NQ79 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRTAC1Q9NQ79 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CRTAC1Q9NQ79 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRTAC1Q9NQ79 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRTAC1Q9NQ79 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRTAC1Q9NQ79 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRTAC1Q9NQ79 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRTAC1Q9NQ79 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRTAC1Q9NQ79 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRTAC1Q9NQ79 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRTAC1Q9NQ79 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRTAC1Q9NQ79 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CRTAC1Q9NQ79 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRTAC1Q9NQ79 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms