Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ50

MRPL40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL40Q9NQ50 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL40Q9NQ50 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms