Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG8

ZDHHC4, Probable palmitoyltransferase ZDHHC4, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC4Q9NPG8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ZDHHC4Q9NPG8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms