Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA1

KCNMB3, Calcium-activated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB3Q9NPA1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNMB3Q9NPA1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNMB3Q9NPA1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNMB3Q9NPA1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNMB3Q9NPA1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNMB3Q9NPA1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNMB3Q9NPA1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNMB3Q9NPA1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNMB3Q9NPA1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNMB3Q9NPA1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNMB3Q9NPA1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNMB3Q9NPA1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNMB3Q9NPA1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNMB3Q9NPA1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNMB3Q9NPA1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNMB3Q9NPA1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNMB3Q9NPA1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNMB3Q9NPA1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNMB3Q9NPA1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNMB3Q9NPA1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNMB3Q9NPA1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNMB3Q9NPA1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNMB3Q9NPA1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNMB3Q9NPA1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNMB3Q9NPA1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNMB3Q9NPA1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNMB3Q9NPA1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNMB3Q9NPA1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNMB3Q9NPA1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNMB3Q9NPA1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNMB3Q9NPA1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNMB3Q9NPA1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNMB3Q9NPA1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNMB3Q9NPA1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNMB3Q9NPA1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNMB3Q9NPA1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNMB3Q9NPA1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNMB3Q9NPA1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNMB3Q9NPA1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNMB3Q9NPA1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNMB3Q9NPA1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNMB3Q9NPA1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNMB3Q9NPA1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNMB3Q9NPA1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNMB3Q9NPA1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNMB3Q9NPA1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNMB3Q9NPA1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNMB3Q9NPA1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNMB3Q9NPA1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNMB3Q9NPA1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms