Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB9BQ9NP90 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB9BQ9NP90 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB9BQ9NP90 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB9BQ9NP90 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB9BQ9NP90 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB9BQ9NP90 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB9BQ9NP90 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB9BQ9NP90 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB9BQ9NP90 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB9BQ9NP90 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB9BQ9NP90 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB9BQ9NP90 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB9BQ9NP90 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB9BQ9NP90 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB9BQ9NP90 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB9BQ9NP90 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB9BQ9NP90 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB9BQ9NP90 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB9BQ9NP90 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB9BQ9NP90 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB9BQ9NP90 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB9BQ9NP90 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB9BQ9NP90 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB9BQ9NP90 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB9BQ9NP90 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB9BQ9NP90 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB9BQ9NP90 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB9BQ9NP90 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB9BQ9NP90 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB9BQ9NP90 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB9BQ9NP90 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB9BQ9NP90 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB9BQ9NP90 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB9BQ9NP90 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB9BQ9NP90 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB9BQ9NP90 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB9BQ9NP90 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB9BQ9NP90 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB9BQ9NP90 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB9BQ9NP90 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB9BQ9NP90 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB9BQ9NP90 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB9BQ9NP90 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB9BQ9NP90 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB9BQ9NP90 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB9BQ9NP90 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB9BQ9NP90 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB9BQ9NP90 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB9BQ9NP90 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms