Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGAP3Q9NP61 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms