Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU8

POLD4, DNA polymerase delta subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD4Q9HCU8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
POLD4Q9HCU8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms