Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCE7

SMURF1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1Q9HCE7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms