Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB8

PPCS, Phosphopantothenate--cysteine ligase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPCSQ9HAB8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPCSQ9HAB8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms