Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9C1

VIPAS39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPAS39Q9H9C1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VIPAS39Q9H9C1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VIPAS39Q9H9C1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VIPAS39Q9H9C1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VIPAS39Q9H9C1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VIPAS39Q9H9C1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VIPAS39Q9H9C1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VIPAS39Q9H9C1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VIPAS39Q9H9C1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VIPAS39Q9H9C1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VIPAS39Q9H9C1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VIPAS39Q9H9C1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VIPAS39Q9H9C1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VIPAS39Q9H9C1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VIPAS39Q9H9C1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VIPAS39Q9H9C1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VIPAS39Q9H9C1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VIPAS39Q9H9C1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VIPAS39Q9H9C1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VIPAS39Q9H9C1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VIPAS39Q9H9C1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VIPAS39Q9H9C1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VIPAS39Q9H9C1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VIPAS39Q9H9C1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VIPAS39Q9H9C1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VIPAS39Q9H9C1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VIPAS39Q9H9C1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VIPAS39Q9H9C1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VIPAS39Q9H9C1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VIPAS39Q9H9C1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VIPAS39Q9H9C1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VIPAS39Q9H9C1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VIPAS39Q9H9C1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VIPAS39Q9H9C1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VIPAS39Q9H9C1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VIPAS39Q9H9C1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VIPAS39Q9H9C1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VIPAS39Q9H9C1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VIPAS39Q9H9C1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VIPAS39Q9H9C1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VIPAS39Q9H9C1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VIPAS39Q9H9C1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VIPAS39Q9H9C1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VIPAS39Q9H9C1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VIPAS39Q9H9C1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VIPAS39Q9H9C1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VIPAS39Q9H9C1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VIPAS39Q9H9C1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VIPAS39Q9H9C1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VIPAS39Q9H9C1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VIPAS39Q9H9C1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms