Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8Y1

VRTN, Vertnin, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VRTNQ9H8Y1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VRTNQ9H8Y1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VRTNQ9H8Y1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VRTNQ9H8Y1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VRTNQ9H8Y1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VRTNQ9H8Y1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VRTNQ9H8Y1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VRTNQ9H8Y1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VRTNQ9H8Y1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VRTNQ9H8Y1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VRTNQ9H8Y1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VRTNQ9H8Y1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VRTNQ9H8Y1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VRTNQ9H8Y1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VRTNQ9H8Y1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VRTNQ9H8Y1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VRTNQ9H8Y1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VRTNQ9H8Y1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VRTNQ9H8Y1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms