Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E9

C8orf33, UPF0488 protein C8orf33, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf33Q9H7E9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms