Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BCAS3Q9H6U6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms