Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6R3

ACSS3, Acyl-CoA synthetase short-chain family member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS3Q9H6R3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms