Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C11orf49Q9H6J7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms