Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRDM12Q9H4Q4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms