Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J1

ARRDC1-AS1, Uncharacterized protein ARRDC1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARRDC1-AS1Q9H2J1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARRDC1-AS1Q9H2J1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARRDC1-AS1Q9H2J1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARRDC1-AS1Q9H2J1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARRDC1-AS1Q9H2J1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARRDC1-AS1Q9H2J1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARRDC1-AS1Q9H2J1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARRDC1-AS1Q9H2J1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARRDC1-AS1Q9H2J1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARRDC1-AS1Q9H2J1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARRDC1-AS1Q9H2J1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARRDC1-AS1Q9H2J1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARRDC1-AS1Q9H2J1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARRDC1-AS1Q9H2J1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARRDC1-AS1Q9H2J1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARRDC1-AS1Q9H2J1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARRDC1-AS1Q9H2J1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARRDC1-AS1Q9H2J1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARRDC1-AS1Q9H2J1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms