Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2I8

LRMDA, Leucine-rich melanocyte differentiation-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRMDAQ9H2I8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRMDAQ9H2I8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms