Protein–RNA interactions for Protein: Q9H159

CDH19, Cadherin-19, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH19Q9H159 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH19Q9H159 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH19Q9H159 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH19Q9H159 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH19Q9H159 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH19Q9H159 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH19Q9H159 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH19Q9H159 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH19Q9H159 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH19Q9H159 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH19Q9H159 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH19Q9H159 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH19Q9H159 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH19Q9H159 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH19Q9H159 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH19Q9H159 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH19Q9H159 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH19Q9H159 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH19Q9H159 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH19Q9H159 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH19Q9H159 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH19Q9H159 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH19Q9H159 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH19Q9H159 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH19Q9H159 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH19Q9H159 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH19Q9H159 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH19Q9H159 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH19Q9H159 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDH19Q9H159 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDH19Q9H159 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDH19Q9H159 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH19Q9H159 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms