Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Y0

ATG10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG10Q9H0Y0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG10Q9H0Y0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG10Q9H0Y0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms