Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0N0

RAB6C, Ras-related protein Rab-6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ9H0N0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB6CQ9H0N0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB6CQ9H0N0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB6CQ9H0N0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB6CQ9H0N0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB6CQ9H0N0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB6CQ9H0N0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB6CQ9H0N0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB6CQ9H0N0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB6CQ9H0N0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB6CQ9H0N0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB6CQ9H0N0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB6CQ9H0N0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB6CQ9H0N0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB6CQ9H0N0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB6CQ9H0N0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB6CQ9H0N0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB6CQ9H0N0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB6CQ9H0N0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB6CQ9H0N0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB6CQ9H0N0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB6CQ9H0N0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB6CQ9H0N0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB6CQ9H0N0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB6CQ9H0N0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB6CQ9H0N0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB6CQ9H0N0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB6CQ9H0N0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB6CQ9H0N0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB6CQ9H0N0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB6CQ9H0N0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB6CQ9H0N0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB6CQ9H0N0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB6CQ9H0N0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB6CQ9H0N0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB6CQ9H0N0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB6CQ9H0N0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB6CQ9H0N0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB6CQ9H0N0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB6CQ9H0N0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB6CQ9H0N0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB6CQ9H0N0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB6CQ9H0N0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB6CQ9H0N0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB6CQ9H0N0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB6CQ9H0N0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms