Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K1

SIK2, Serine/threonine-protein kinase SIK2, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK2Q9H0K1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIK2Q9H0K1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIK2Q9H0K1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIK2Q9H0K1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIK2Q9H0K1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIK2Q9H0K1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIK2Q9H0K1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIK2Q9H0K1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIK2Q9H0K1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIK2Q9H0K1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIK2Q9H0K1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIK2Q9H0K1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIK2Q9H0K1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIK2Q9H0K1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIK2Q9H0K1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SIK2Q9H0K1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms