Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
POLR1EQ9GZS1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms