Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP44Q9C0F1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms