Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNTNAP4Q9C0A0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNTNAP4Q9C0A0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNTNAP4Q9C0A0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNTNAP4Q9C0A0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNTNAP4Q9C0A0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNTNAP4Q9C0A0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNTNAP4Q9C0A0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CNTNAP4Q9C0A0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CNTNAP4Q9C0A0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CNTNAP4Q9C0A0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CNTNAP4Q9C0A0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CNTNAP4Q9C0A0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CNTNAP4Q9C0A0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CNTNAP4Q9C0A0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CNTNAP4Q9C0A0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNTNAP4Q9C0A0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNTNAP4Q9C0A0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNTNAP4Q9C0A0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNTNAP4Q9C0A0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNTNAP4Q9C0A0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNTNAP4Q9C0A0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CNTNAP4Q9C0A0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CNTNAP4Q9C0A0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CNTNAP4Q9C0A0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNTNAP4Q9C0A0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNTNAP4Q9C0A0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNTNAP4Q9C0A0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNTNAP4Q9C0A0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNTNAP4Q9C0A0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNTNAP4Q9C0A0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNTNAP4Q9C0A0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CNTNAP4Q9C0A0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CNTNAP4Q9C0A0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CNTNAP4Q9C0A0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CNTNAP4Q9C0A0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CNTNAP4Q9C0A0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CNTNAP4Q9C0A0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CNTNAP4Q9C0A0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CNTNAP4Q9C0A0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CNTNAP4Q9C0A0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CNTNAP4Q9C0A0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CNTNAP4Q9C0A0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CNTNAP4Q9C0A0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CNTNAP4Q9C0A0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CNTNAP4Q9C0A0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms