Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT23Q9C075 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT23Q9C075 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT23Q9C075 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT23Q9C075 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT23Q9C075 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT23Q9C075 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT23Q9C075 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT23Q9C075 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT23Q9C075 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT23Q9C075 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT23Q9C075 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT23Q9C075 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT23Q9C075 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
KRT23Q9C075 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
KRT23Q9C075 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
KRT23Q9C075 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT23Q9C075 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT23Q9C075 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT23Q9C075 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT23Q9C075 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT23Q9C075 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT23Q9C075 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT23Q9C075 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT23Q9C075 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT23Q9C075 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT23Q9C075 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT23Q9C075 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT23Q9C075 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT23Q9C075 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT23Q9C075 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT23Q9C075 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT23Q9C075 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT23Q9C075 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT23Q9C075 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT23Q9C075 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT23Q9C075 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT23Q9C075 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT23Q9C075 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT23Q9C075 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT23Q9C075 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT23Q9C075 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT23Q9C075 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT23Q9C075 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT23Q9C075 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT23Q9C075 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT23Q9C075 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT23Q9C075 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT23Q9C075 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT23Q9C075 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT23Q9C075 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT23Q9C075 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT23Q9C075 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT23Q9C075 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT23Q9C075 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT23Q9C075 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT23Q9C075 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT23Q9C075 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT23Q9C075 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT23Q9C075 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT23Q9C075 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT23Q9C075 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KRT23Q9C075 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KRT23Q9C075 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KRT23Q9C075 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT23Q9C075 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT23Q9C075 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT23Q9C075 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT23Q9C075 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT23Q9C075 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT23Q9C075 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT23Q9C075 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT23Q9C075 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT23Q9C075 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT23Q9C075 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT23Q9C075 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT23Q9C075 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT23Q9C075 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT23Q9C075 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT23Q9C075 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT23Q9C075 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT23Q9C075 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT23Q9C075 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT23Q9C075 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT23Q9C075 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT23Q9C075 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT23Q9C075 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT23Q9C075 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT23Q9C075 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT23Q9C075 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT23Q9C075 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT23Q9C075 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT23Q9C075 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT23Q9C075 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT23Q9C075 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT23Q9C075 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT23Q9C075 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT23Q9C075 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT23Q9C075 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT23Q9C075 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms