Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW4

TM6SF2, Transmembrane 6 superfamily member 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF2Q9BZW4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM6SF2Q9BZW4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM6SF2Q9BZW4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM6SF2Q9BZW4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM6SF2Q9BZW4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM6SF2Q9BZW4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM6SF2Q9BZW4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM6SF2Q9BZW4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM6SF2Q9BZW4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM6SF2Q9BZW4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TM6SF2Q9BZW4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM6SF2Q9BZW4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM6SF2Q9BZW4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM6SF2Q9BZW4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM6SF2Q9BZW4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM6SF2Q9BZW4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM6SF2Q9BZW4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TM6SF2Q9BZW4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TM6SF2Q9BZW4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TM6SF2Q9BZW4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM6SF2Q9BZW4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TM6SF2Q9BZW4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM6SF2Q9BZW4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM6SF2Q9BZW4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM6SF2Q9BZW4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM6SF2Q9BZW4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM6SF2Q9BZW4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM6SF2Q9BZW4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM6SF2Q9BZW4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TM6SF2Q9BZW4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TM6SF2Q9BZW4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TM6SF2Q9BZW4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TM6SF2Q9BZW4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TM6SF2Q9BZW4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TM6SF2Q9BZW4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TM6SF2Q9BZW4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TM6SF2Q9BZW4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TM6SF2Q9BZW4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM6SF2Q9BZW4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM6SF2Q9BZW4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM6SF2Q9BZW4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM6SF2Q9BZW4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM6SF2Q9BZW4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM6SF2Q9BZW4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TM6SF2Q9BZW4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM6SF2Q9BZW4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM6SF2Q9BZW4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM6SF2Q9BZW4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM6SF2Q9BZW4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM6SF2Q9BZW4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM6SF2Q9BZW4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM6SF2Q9BZW4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM6SF2Q9BZW4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM6SF2Q9BZW4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM6SF2Q9BZW4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM6SF2Q9BZW4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM6SF2Q9BZW4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM6SF2Q9BZW4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM6SF2Q9BZW4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM6SF2Q9BZW4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM6SF2Q9BZW4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TM6SF2Q9BZW4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms