Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms