Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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