Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
GABARAPL3Q9BY60 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms