Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL25A1Q9BXS0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms