Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW19

KIFC1, Kinesin-like protein KIFC1, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFC1Q9BW19 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIFC1Q9BW19 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIFC1Q9BW19 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIFC1Q9BW19 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIFC1Q9BW19 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIFC1Q9BW19 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KIFC1Q9BW19 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIFC1Q9BW19 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIFC1Q9BW19 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIFC1Q9BW19 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIFC1Q9BW19 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIFC1Q9BW19 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIFC1Q9BW19 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIFC1Q9BW19 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIFC1Q9BW19 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIFC1Q9BW19 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIFC1Q9BW19 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIFC1Q9BW19 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIFC1Q9BW19 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIFC1Q9BW19 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIFC1Q9BW19 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIFC1Q9BW19 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KIFC1Q9BW19 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIFC1Q9BW19 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIFC1Q9BW19 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIFC1Q9BW19 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIFC1Q9BW19 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIFC1Q9BW19 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIFC1Q9BW19 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIFC1Q9BW19 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KIFC1Q9BW19 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIFC1Q9BW19 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIFC1Q9BW19 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIFC1Q9BW19 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIFC1Q9BW19 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIFC1Q9BW19 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIFC1Q9BW19 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIFC1Q9BW19 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIFC1Q9BW19 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIFC1Q9BW19 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIFC1Q9BW19 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIFC1Q9BW19 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIFC1Q9BW19 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIFC1Q9BW19 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIFC1Q9BW19 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms