Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM106CQ9BVX2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM106CQ9BVX2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM106CQ9BVX2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM106CQ9BVX2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM106CQ9BVX2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM106CQ9BVX2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM106CQ9BVX2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM106CQ9BVX2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM106CQ9BVX2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM106CQ9BVX2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM106CQ9BVX2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM106CQ9BVX2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM106CQ9BVX2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM106CQ9BVX2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM106CQ9BVX2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM106CQ9BVX2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms