Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PTDSS2Q9BVG9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms