Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms