Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV44

THUMPD3, THUMP domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD3Q9BV44 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
THUMPD3Q9BV44 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
THUMPD3Q9BV44 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
THUMPD3Q9BV44 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
THUMPD3Q9BV44 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
THUMPD3Q9BV44 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
THUMPD3Q9BV44 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
THUMPD3Q9BV44 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
THUMPD3Q9BV44 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
THUMPD3Q9BV44 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
THUMPD3Q9BV44 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
THUMPD3Q9BV44 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
THUMPD3Q9BV44 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms